醫療保障制度固然擁有社會保障制度的一般特征，但與養老保險等其他社會保障相比，醫保的核心目標是讓廣大參保人能夠獲得最基本的醫療保障，這一特殊性向醫療保障制度的管理體制提出了要求：醫保的統籌管理，不能回避醫療衛生的專業性和權威性；醫保由衛生部門統籌，更切合民生、切合醫改，也更符合現有體制轉型的演進趨勢。

　應盡量做到協調成本內部化

　與其他社會保障形式相比，醫療保障涉及政府管理機構、經辦機構、用人單位、醫療服務機構、參保人等多方主體之間的復雜權利、義務關系，并且需要協調籌資、醫療服務提供、服務質量、參保人健康、經辦機構等多個要素之間的關系。因此應盡量做到協調成本內部化，避免由幾個政府部門管理制度，造成行政摩擦，增加管理成本。

　同時，醫療保障對國家醫藥衛生體系具有高度依賴性。一個包含醫療保障管理職能的衛生行政管理體制，將在最大限度上促進醫療保障制度目標的實現。醫療保障不僅是社會保障的組成部分，也是醫藥衛生體系不可或缺的組成部分。醫療保障制度框架下的支付制度、醫療服務質量管理、參保人滿意度管理等與國家醫藥衛生體系有著千絲萬縷的關系。醫療保障與公共衛生、藥品流通、服務提供等體系密切相關，國家醫藥衛生體系建設不成功，醫療保障制度就不可能成功建立。

　因此，在一個統一協調的管理框架中兼顧保障基金和醫療服務，是構建醫療保障管理體制時應追求的目標。醫療服務的管理有兩個層次：第一個層次是在形式上提供醫療服務；第二個層次是在實質上對所提供的醫療服務進行全面監管，包括根據衛生事業發展需要、參保人健康需求和保障基金承受能力等多方面的因素，合理確定和適時、科學調整服務包，出臺臨床路徑、醫療規范和標準等，來保證醫療衛生服務質量，并對參保人服務包使用情況的合理性、滿意度以及基金的使用情況進行嚴格監管。

　管理醫療保障制度時需平衡三個核心要素，即保障基金、醫療服務提供和醫療服務監管。當這三個核心要素由一個政府行政部門統籌管理時，一方面可以減少部門間的矛盾，另一方面可以在最大限度上平衡三個要素之間的關系，趨利避害，達到各方利益最大化。