從此改變了醫院一直以來各自為政、零散取用的粗放型收集取用模式,成功轉變成為規范化、集中化的集約型生物樣本收集管理模式。復旦大學附屬腫瘤醫院組織庫現為“國際生物和環境樣本協會(ISBER)”會員單位;“中國醫藥生物技術協會組織生物樣本庫分會”常委單位;“中國生物樣本庫聯盟”發起單位;“全國生物樣本標準化技術委員會”人類生物樣本庫標準化工作組成員單位。
總建筑面積500㎡,分為樣本處理區、存儲區、實驗區、信息處理和辦公區。其主要職能是采集、貯存患者的血液、組織、核酸以及其他體液樣本、以及樣本配套臨床病理等信息,為院內外基礎和轉化研究提供樣本、組織芯片、質量控制、人員培訓、臨床試驗和資源共享等服務。目前樣本收集存儲量達19萬例,可供使用量達168萬份。目前存儲的樣本涵蓋了液氮凍存組織、RNAlater保存組織、石蠟包埋組織、血清、血漿、白細胞、 DNA、RNA、尿液、唾液、胰液、膽汁和腦脊液等多種類型。
復旦大學附屬腫瘤醫院組織庫(圖片來源于網絡)
2010-2013年,在“985 工程”醫科學術發展建設項目——“惡性腫瘤的遺傳易感、早期診斷與個體化綜合治療研究平臺的建設與應用”支持下,復旦大學附屬腫瘤醫院組織庫聯合7家復旦大學附屬醫院建成復旦大學樣本庫網絡信息平臺,該平臺集成各科研機構現有不同形式的生物樣本庫,應用經多年實踐已經成熟的統一規范,將樣本收集、管理和應用網絡化,使得復旦大學附屬醫院系統的生物樣本收集、處理、管理和調用實現規范化,有效促進了樣本的利用和科研產出。
2012年,為貫徹實施上海市中長期科技發展規劃及“十二五”規劃,進一步提升本市樣本庫科技創新水平和公共服務能力,由復旦大學附屬腫瘤醫院組織庫牽頭,與7家來自復旦大學、上海交通大學、同濟大學、第二軍醫大學和上海中醫藥大學的醫院共同承擔上海市科學技術委員會科研計劃項目“常見惡性腫瘤生物樣本庫網絡建設”課題,在該項目支持下建成上海市專業技術服務平臺——惡性腫瘤生物樣本庫,并形成生物樣本庫聯盟,該聯盟圍繞本市重大疾病防治研究以及醫藥產業發展需求,建設重大疾病臨床生物樣本實體庫及信息共享服務系統,利用網絡平臺實現集成臨床診斷、用藥治療、檢驗檢查和樣本采集保存等信息的一站式查詢服務功能,同時提供樣本與信息共享、人員培訓服務。服務特色如下:
1) 服務范圍:上海市、全國乃至全球
2) 服務領域:科研項目、生物醫藥企業、樣本庫
3) 服務內容:高質量生物樣本及其信息、相關輸出服務
4) 服務規模:>20000例常見惡性腫瘤及特色腫瘤樣本,多種形式
5) 服務模式:開放服務
6) 服務標準:ISBER最佳實踐、中國樣本庫標準
2006年至今,復旦大學附屬腫瘤醫院組織庫先后制定了樣本收集知情同意書、樣本轉移協議、惡性腫瘤生物樣本庫標準操作流程、國際和國內合作協議模板,逐漸將惡性腫瘤生物樣本相關工作合法合規化、標準化和制度化,為促進行業可持續發展不懈努力。2013年,復旦大學附屬腫瘤醫院組織庫率先向國際生物和環境樣本庫協會(ISBER)遞交了生物樣本庫室間質評工作,在"全血DNA抽提、組織樣本組織學方案、DNA定量和純度方案和RNA完整性方案"方面為全國首家獲得ISBER頒發的PT證書的樣本庫。
生物樣本庫的工作重心在于服務。復旦大學附屬腫瘤醫院組織庫成立11年以來,已經幫助430項科研項目得到高質量的研究樣本,并為多項國家科技重大專項提供樣本支持,如: 2項國家重點基礎研究發展計劃(亦稱973計劃)、1項國家高技術研究發展計劃(863計劃)、9項985工程優勢學科創新平臺項目、10項千人計劃、4項十一五/十二五重大專項、1項國家科技重大專項重大新藥創制專項等。在組織庫支持下,復旦大學附屬腫瘤醫院科研產出逐年遞增。而在院內共享的同時,復旦大學附屬腫瘤醫院組織庫也為多個國內外科研院所如:美國國家癌癥研究院(NCI)、美國DUKE大學醫學院腫瘤中心、美國西北大學、中國醫學科學院協和腫瘤醫院、中山大學腫瘤防治中心等提供科研合作、樣本及技術服務、樣本加工、技術支持和人員培訓等優質服務。生物樣本庫人員培訓是一個長期的工程,知識產生而后更新,人員知識的更新產生新的技術、新的流程,進而推動行業領域前行。截至2016年底,復旦大學附屬腫瘤醫院組織庫共計向225家單位608人次提供參觀學習和技術培訓服務,向46家單位提供進修學習服務。
11年來,復旦大學附屬腫瘤醫院組織庫不懈努力,于日常工作、行業標準、知識共享、校際國際合作等各方面均獲得佳績:全國第一家與NCI合作提供蛋白質組研究的腫瘤樣本;全國第一家獲得“人類遺傳資源采集、收集、買賣、出口、出境”的行政許可;全國第一家建立惡性腫瘤生物樣本庫共享平臺;全國第一個在ISBER委員會任職的生物樣本庫;全國首家由醫院生物樣本庫主辦的亞洲研究資源聯盟中心(AsianNetwork of Research Resource Center, ANRRC)會議;連續舉辦六屆生物樣本庫論壇暨培訓,其中四次為國家級繼續醫學教育項目;首次開辦面向復旦大學博士、碩士“生物樣本庫”課程,為普及生物樣本庫知識、儲備新一代生物樣本庫的人員力量作理論準備;出版了第一本惡性腫瘤生物樣本庫標準操作流程,共享多年工作經驗。